يعمل قطاع سلامة الطيران بالهيئة العامة للطيران المدني والأرصاد على تحقيق أهداف الهيئة المنبثقة من سياسة الدولة في التنمية الاقتصادية للبلاد ، من خلال تنفيذه للمهام المناطة به والمتعلقة بسلامة الطيران المدني وفقاً لتشريعات الطيران المدني الوطنية والدولية .
يتضمن هيكل القطاع من أربع إدارات عامة هي :ـ
- مستويات المطارات وخدمات الحركة الجوية
- صلاحية الطيران
- عمليات الطيران
- الإجازات والاختبارات
بالإضافة إلى إدارة التحقيق في حوادث الطيران ، وإدارة التنسيق وشئون المنظمة الدولية والشئون المالية والإدارية .
كما يوجد لدى القطاع مكتبة فنية شاملة لكافة الوثائق الدولية واللوائح والأنظمة ذات العلاقة بالطيران المدني .
يُشرف القطاع بموجب قانون الطيران على نشاط الطيران المدني في البلاد من حيث مراعاة مقدمي الخدمة كالشركات العاملة في حقل الطيران والمطارات حاملي الإجازات لمعايير السلامة .
كما يقوم القطاع بإصدار تراخيص إنشاء شركات الطيران والمطارات ومدارس تعليم الطيران وإجراء كافة الاختبارات للحصول على الإجازات والتصاريح للطيارين والمهندسين والمرحلين والمراقبين الجويين وأطقم الضيافة .